O objetivo do projeto Atlantic Blue Ports é o de utilizar um sistema protótipo de tratamento de águas de lastro (água de lastro é a água do mar captada pelo navio para garantir a segurança operacional do navio e sua estabilidade. Em geral, os tanques são preenchidos com maior ou menor quantidade de água para aumentar ou diminuir o calado dos navios durante as operações portuárias) dos navios, a quando da estadia em Porto.
Com o tratamento das águas de lastro dos navios não estamos a permitir que espécies marinhas invasoras contaminem a água do mar, protegendo assim a fauna e a flora subaquáticas, bem como a produção de organismos subaquáticos de aquacultura.
Este projeto junta entidades públicas e privadas dos seguintes países: França, Holanda, Espanha, Portugal e Reino Unido.